Рассмотрим рифтовые озера Африки.  В природе разные виды африканских цихлид обычно не скрещиваются между собой (собственно, поэтому они и считаются разными видами, а не разновидностями). Репродуктивная изоляция обеспечивается в основном брачными предпочтениями. По-видимому, одним из главных факторов, обеспечивших быстрое видообразование у цихлид, был половой отбор. В природе для предотвращения гибридизации вполне достаточно брачных предпочтений, поэтому дополнительные изолирующие механизмы цихлидам не требуются, и они могут не возникать очень долго. Генетическая несовместимость развивается пассивно, как побочный результат накопления различий в изолированных генофондах, и на это требуется много времени — несколько миллионов лет, иногда даже более 10 миллионов. Это было показано путем сопоставления экспериментов по межвидовой гибридизации с оценками времени расхождения видов на основе сравнения их ДНК, с учетом геологической истории озер. Важную роль при выборе партнера играет зрение: самцы каждого вида имеют свой особый наряд, а самки превосходно разбираются в нюансах их окраски. Недавно было показано, что зрение у разных видов цихлид может быть специально «настроено» на спектральные характеристики брачного наряда: например, если самцы у данного вида синие, то и глаза наиболее чувствительны именно к синим оттенкам (см.: Terai Y. et al.Divergent selection on opsins drives incipient speciation in Lake Victoria cichlids // PLoS Biology. 2006. № 4. P. e433.  Опсины — это группа светочувствительных связанных с мембраной рецепторов, связанных с G-белками, массой около 35-55 кДа семейства ретинолидных белков, которые обнаружены в фоточувствительных клетках сетчатки. Пять групп опсинов принимают участие в зрении, передаче света в электрохимический сигнал, и являются первым этапом в каскаде зрительной трансдукции. Меланопсин — другой опсин, обнаруженный в сетчатке млекопитающих, который участвует в циркадианных ритмах и в зрачковом рефлексе, но не в формировании изображения. На примере опсинов удобно изучать эволюцию, поскольку в данном случае имеет место практически однозначное соответствие между генами и фенотипическими признаками (особенностями цветового восприятия). Исследователи из США, Австралии и Швейцарии опубликовали в журнале PLoS Biology результаты широкомасштабного исследования опсинов у 54 видов цихлид из озера Малави и 11 видов из озера Виктория. У цихлид имеется один ген «черно-белого» опсина палочек (Rh1) и целых шесть классов «цветных» опсинов колбочек: SWS1 (ультрафиолетовый), SWS2B (фиолетовый), SWS2A (синий), Rh2B (голубой, или сине-зеленый),Rh2A (зеленый), LWS (красный). Авторы измерили активность опсиновых генов у всех изученных видов в обоих типах колбочек. Оказалось, что разные виды цихлид, в том числе и близкородственные, сильно различаются по относительной активности шести опсиновых генов. В озере Малави, где вода прозрачная, цихлиды используют все шесть генов, хотя и в очень разной степени. Малавийские виды распадаются на три группы, сетчатка которых наиболее чувствительна к коротким, средним и длинным световым волнам (рис. 3). В озере Виктория, где вода мутная, цихлиды почти не используют гены «ультрафиолетового» и «сине-зеленого» опсинов. У всех изученных цихлид из Виктории сетчатка наиболее чувствительна к длинноволновому свету, который лучше проходит сквозь мутную воду. Напомним, что «ультрафиолетовый» опсин является самым коротковолновым из опсинов простых колбочек, а «сине-зеленый» — самый коротковолновый из опсинов двойных колбочек.  http://elementy.ru/novosti_nauki/431229/Evolyutsiya_tsvetnogo_zreniya_u_afrikanskikh_tsikhlid_shla_dvumya_putyami Интересный факт, как в условиях тесного проживания в озере, разным локалитетам и видам удается избежать гибридизации. Так между Meponda (Мепонда, Мозамбик) и Nkhungu Reef (риф Нкунгу, Мозамбик) простирается участок скалистого побережья длиной 55км. Представители M.estherae здесь, по-видимому, не встречаются, однако, на этом участке обитает другая «зебра». Самки этой популяции, как правило, светло-коричневые, но встречаются как оранжевые, так и пятнистые экземпляры. Эта популяция, вероятно, является географическим локалитетом M.estherae. У самцов, обитающих на этой территории, нижняя часть головы окрашена в синий цвет, а корпус тела в насыщенно голубой. Конингс назвал ееMetriaclima sp. “estherae blueface” (синелицая). Отсутствие гибридизации между Metriaclima estherae и Metriaclima sp. “estherae blueface”, вероятно, объясняется способностью обоих полов четко различать своих партнеров. И даже самые незначительные различия в окраске и запахе разных видов помогают в выборе, что является гарантией чистоты популяций.  http://aquaria-info.ru/content/pre-krasnaya-zebra-metriaclima-estherae   на фото разные локалитеты ципров образующих смешанные стаи в озере но не скреивающиеся.  Представители рода Cyprichromis обычно встречаются огромными стаями, в которые иногда собирается более 10,000 особей. Такие стаи обычно состоят из представителей разных видов, и довольно просто встретить вместе два а то и три разных вида Cyprichromis - C. leptosoma, C. pavo (или C. microlepidotus), и C. sp. " Leptosoma Jumbo" - кормящихся вместе среди планктона. Интересно что существует несколько различных типов стай. Кормящиеся стаи главным образом состоят из взрослых самок и не територриальных самцов. Ближе к скалистому субстрату, стаи, состоят главным образом из территориальных самцов, (и выглядят более статичными); обычно в этих районах можно встретить и стаи зрелых готовых к нересту самок. Самцы остаются на некотором удалении друг от друга, и рядом могут соседствовать все четыре известных вида Cyprichromis. Третий тип стай - это инкубирующие самки, и хотя обычно такие стаи состоят из предстваителей одного вида, можно встретить и смешанные группы. Члены рода Cyprichromis, подобно большинству других инкубирующих цихлид, являются территориальными рыбами, но отличаются от прочих видов тем, что их территории является трехмерной. Интересно наблюдать как тысячи самцов, защищающих свои территории не на площади субстрата, а в объеме воды. Один самец обычно "столбит" куб, приблизительно в 3 фута (около 1 метра) по вертикали и горизонтали, и его соседями могут быть различные разновидности Cyprichromis или самцы того же вида, но другой цветовой морфы. Самцы остаются постоянно в центре своей объемной территории и энергично отгоняют, покушающихся на их "пределы" соседних самцов. Одновременно не выпускаются из внимания и проплывающие мимо самки, которые активно привлекаются самцами в свои "сферы влияния".